这里是将超能力认知为一般科学的反超自然学园都市。一名白衣修女从天而降，来到高中生上条当麻的房间。但那名修女装扮的少女却表示，她是从魔法的世界逃到这里来的。上条对这个自称是****目录的神秘少女的言行相当怀疑，然而真正的魔法师，却在两人眼前出现──！！